Según el más reciente reporte del «Ranking U-Sapiens 2019-1», que clasifica a las mejores Instituciones de Educación Superior (IES) de Colombia, teniendo en cuenta los indicadores de investigación, la Universidad Santo Tomás  Sede Bogotá, se ubicó en el puesto 25 de 360 universidades.

De acuerdo con el reporte del «Ranking ART Sapiens 2018», que clasifica a las mejores Instituciones de Educación Superior (IES) de Colombia, según el posicionamiento internacional de artículos científicos, la Universidad Santo Tomás Sede Bogotá, se ubicó en el puesto 34 entre 358 IES  que se analizaron en el país.